Annotateur Spectral de Peptides Interactif : Un Outil Polyvalent Basé sur le Web pour des Applications Protéomiques

Nous présentons IPSA, un annotateur de spectre innovant basé sur le web qui visualise et caractérise les spectres de masse en tandem de peptides. Un outil pour la communauté scientifique, IPSA peut visualiser des peptides collectés à l'aide d'une grande variété de configurations expérimentales et instrumentales. Les spectres annotés sont personnalisables via une sélection de fonctionnalités interactives et peuvent être exportés sous forme de graphiques vectoriels évolutifs modifiables pour aider à la production de figures de qualité publication. Les spectres uniques peuvent être analysés à travers des formulaires web fournis, tandis que les données pour plusieurs correspondances de spectres de peptides peuvent être téléchargées en utilisant les formats de fichiers de l'Initiative des Normes en Protéomique mzTab, mzIdentML et mzML. Alternativement, les identifications de peptides et les données spectrales peuvent être fournies à l'aide de formats de fichiers génériques. IPSA offre un soutien pour annoter les spectres collectés en utilisant l'ionisation en mode négatif et facilite la caractérisation de la performance expérimentale MS/MS grâce à l'exportation optionnelle des statistiques des ions fragments de une à plusieurs correspondances de spectres de peptides. Cette ressource est librement accessible à http://interactivepeptidespectralannotator.com, tandis que le code source et les guides utilisateurs sont disponibles sur https://github.com/coongroup/IPSA pour un hébergement privé ou des implémentations personnalisées.