Protéines d'enveloppe et de membrane de Sars‐CoV‐2 : différences structurelles liées aux caractéristiques du virus ?

La maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) est une nouvelle infection virale causée par le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2). Des analyses génomiques ont révélé que le SARS-CoV-2 est lié aux coronavirus de Pangolin et de Chauve-souris. Dans ce rapport, une comparaison structurelle entre les protéines d'enveloppe et de membrane de Sars-CoV-2 provenant de différents isolats humains avec les protéines homologues de virus étroitement apparentés est décrite. Les analyses rapportées ici montrent la haute similarité structurelle des protéines d'enveloppe et de membrane avec celles des isolats de coronavirus de Pangolin et de Chauve-souris. Cependant, les comparaisons ont également mis en évidence des différences structurelles spécifiques aux protéines de Sars-CoV-2 qui peuvent être corrélées à la transmission interespèces et/ou aux propriétés du virus. La modélisation structurelle a été appliquée pour cartographier les sites variants sur la structure tridimensionnelle prédite des protéines d'enveloppe et de membrane.