Une méthode nonenzymatique pour cliver les polysaccharides et obtenir des oligosaccharides pour l'analyse structurelle

Les polysaccharides sont les biomolécules les plus abondantes dans la nature, mais elles sont les moins comprises en termes de leurs structures chimiques et de leurs fonctions biologiques. Les polysaccharides ne peuvent pas simplement être séquencés car ils sont souvent très ramifiés et manquent d'une structure uniforme. De plus, les grandes structures polymériques ne peuvent pas être analysées directement par des techniques de spectrométrie de masse, un problème qui a été résolu pour les polynucléotides et les protéines. Alors que les enzymes de restriction ont fait progresser l'analyse génomique, et que la trypsine a fait avancer l'analyse protéomique, il n'existe pas d'enzyme équivalente pour la digestion universelle des polysaccharides. Nous décrivons le développement et l'application d'une méthode chimique pour produire des oligosaccharides à partir de polysaccharides. Les oligosaccharides libérés sont caractérisés par des méthodes de chromatographie liquide-spectrométrie de masse (LC-MS) avancées avec une haute sensibilité, précision et débit. La technique est d'abord utilisée pour identifier les polysaccharides par empreinte digitale d'oligosaccharides. Ensuite, les compositions de polysaccharides des aliments et des fèces sont déterminées, illustrant davantage l'utilité de la technique dans les études alimentaires et cliniques.