Étude taxonomique de Weissella confusa et description de Weissella cibaria sp. nov., détectée dans des échantillons alimentaires et cliniques.

Une étude taxonomique a été réalisée pour clarifier les relations de deux populations bactériennes appartenant au genre Weissella. Un total de 39 souches provenant principalement d'aliments malaisiens (22 souches) et d'échantillons cliniques humains (9 souches) et animaux (6 souches) ont été analysées en utilisant une approche taxonomique polyphasique. Les méthodes comprenaient le phénotypage classique, l'électrophorèse des protéines de cellules entières, le RFLP de l'ADN ribosomal 16S et 23S (ribotypage), la détermination des homologies de séquences de l'ADN ribosomal 16S et les niveaux de réassociation ADN-ADN. En fonction des résultats, les souches ont été considérées comme représentant deux espèces différentes, Weissella confusa et une nouvelle espèce de Weissella, pour laquelle le nom Weissella cibaria sp. nov. est proposé. Weissella confusa possédait la similitude de séquence d'ADN ribosomal 16S la plus élevée avec Weissella cibaria, mais l'expérience de réassociation ADN-ADN a montré des niveaux d'hybridation inférieurs à 49 % entre les souches étudiées. Les analyses numériques des souches de Weissella confusa et Weissella cibaria n'ont révélé aucun regroupement spécifique par rapport à l'origine des souches. Sur la base de l'électrophorèse des protéines de cellules entières et des motifs de ribotypage ClaI et HindIII, les isolats alimentaires et cliniques étaient répartis aléatoirement dans les deux grappes spécifiques à l'espèce obtenues.