Analyse d'image pour le comptage et la classification des oocystes d'Eimeria

La technique de comptage McMaster est la méthode standard utilisée pour énumérer les oocystes de coccidies dans les élevages de volailles. Elle permet également de distinguer les espèces de coccidies en fonction de la taille de leurs oocystes. Le McMaster est une technique manuelle, qui peut être ardue et chronophage. Dans cette étude, nous présentons une méthode de quantification et de classification des Eimeria utilisant le programme de traitement d'images, FIJI ImageJ (ImageJ). Nous avons comparé 34 échantillons de litière provenant de différents poulaillers. Les oocystes ont été chargés et flottés dans une chambre McMaster, où ils ont été comptés manuellement et par ImageJ. Lorsque les paramètres du logiciel ont été utilisés pour compter tous les oocystes sans tenir compte de la taille, des différences statistiques ont été trouvées entre les deux techniques; cependant, lorsque les paramètres ont été réglés pour identifier la taille et la circularité spécifiques des oocystes, aucune différence statistiquement significative n'a été trouvée entre les résultats de la technique de comptage McMaster et ImageJ. Prendre la somme des tailles individuelles des oocystes (petits, moyens et grands) a fourni un comptage total similaire à celui obtenu par la méthode manuelle. De plus, aucune différence statistique n'a été trouvée dans les comptages des oocystes d'Eimeria sp. par l'une ou l'autre méthode. Cependant, une petite mais significative différence statistique a été trouvée entre les comptages obtenus en utilisant les deux méthodes pour les oocystes de taille moyenne (classés provisoirement comme E. necatrix, E. precox et E. tenella ensemble). Dans l'ensemble, le comptage automatique utilisant ImageJ a été démontré comme étant une méthode précise et rapide pour compter et spécier les Eimeria.