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La transplantation de microbiote fécal (FMT) est une instillation dans le côlon, ou l'administration par le tractus gastro-intestinal supérieur, de selles provenant d'un donneur sain à un receveur atteint d'une maladie présumée liée à un microbiome intestinal altéré. La FMT a été utilisée avec succès pour traiter l'infection récurrente à Clostridium difficile (rCDI). Le succès à court terme de la FMT dans la rCDI a conduit à des recherches sur son application à d'autres troubles gastro-intestinaux et maladies extra-intestinales associées à une dysbiose intestinale présumée. Malgré les résultats prometteurs de la FMT dans ces affections, plusieurs obstacles subsistent, notamment la détermination des caractéristiques d'un microbiome sain, la garantie de la sécurité du receveur en ce qui concerne les résultats à long terme, la surveillance adéquate du receveur de matériel fécal, l'obtention d'un contrôle de haute qualité et le maintien de coûts raisonnables. Pour ces raisons, l'établissement de protocoles uniformes pour la préparation des selles, l'identification des meilleurs modes d'administration de la FMT, la tenue de vastes bases de données de donneurs et de receveurs, et l'assurance que l'ingestion orale est équivalente à l'instillation coloscopique plus largement acceptée sont des questions qui doivent être abordées.
Kim et al. (Tue,) ont étudié cette question.