Amis ou ennemis—Interactions microbiennes dans la nature

Les microorganismes sont présents dans presque tous les niches de la Terre et n'existent principalement pas seuls, mais forment des communautés d'espèces uniques ou mixtes. Au sein de telles populations microbiennes et entre les microbes et un hôte eucaryote, diverses interactions microbiennes se produisent dans un environnement en constante évolution. Ces interactions microbiennes sont cruciales pour un établissement réussi et le maintien d'une population microbienne. L'unité de base de l'interaction est l'expression génique de chaque organisme dans cette communauté en réponse à des stimuli biotiques ou abiotiques. L'expression génique différentielle est responsable de la production de molécules échangeables impliquées dans les interactions, menant finalement à un comportement communautaire. Les interactions coopératives et compétitives au sein des communautés bactériennes et entre les bactéries associées et l'hôte sont l'objet de cette revue, mettant l'accent sur la communication cellule-cellule microbienne (détection de quorum). De plus, la métagénomique est discutée comme un outil utile pour analyser les informations génomiques complexes des communautés microbiennes et le rôle fonctionnel de différents microbes au sein d'une communauté, ainsi que pour identifier de nouvelles biomolécules pour des applications biotechnologiques.