Le Catalogue des Bactéries Gastro-intestinales de Souris permet la traduction entre les microbiotes intestinaux de la souris et de l'homme via une cartographie fonctionnelle

La santé et les maladies humaines ont de plus en plus été montrées comme étant impactées par le microbiote intestinal, et les modèles murins sont essentiels pour enquêter sur ces effets. Cependant, les compositions des microbiotes intestinaux humains et murins sont distinctes, limitant la traduction de la recherche sur le microbiote entre ces hôtes. Pour y remédier, nous avons construit le Catalogue des Bactéries Gastro-intestinales de Souris (MGBC), un dépôt de 26 640 génomes bactériens dérivés de microbiotes de souris de haute qualité. Ce catalogue permet des analyses à l'échelle des espèces pour cartographier les fonctions d'intérêt et identifier des taxa fonctionnellement équivalents entre les microbiotes des humains et des souris. Nous avons complété cela par une collection déposée publiquement de 223 isolats bactériens, y compris 62 espèces auparavant non cultivées, pour faciliter l'investigation expérimentale des fonctions de bactéries commensales individuelles in vitro et in vivo. Ensemble, ces ressources offrent la possibilité d'identifier et de tester des membres fonctionnellement équivalents des microbiotes intestinaux spécifiques à l'hôte des humains et des souris et soutiennent l'utilisation éclairée des modèles murins dans la recherche sur le microbiote humain.