Microbiome végétal : un compte rendu des facteurs qui façonnent la composition et la diversité des communautés

Les plantes vivent en association avec divers micro-organismes, appelés collectivement le microbiome. Ces microbes vivent soit à l'intérieur (endosphère) soit à l'extérieur (épigène) des tissus des plantes. Les microbes jouent des rôles importants dans l'écologie et la physiologie des plantes. Des progrès significatifs ont été réalisés ces dernières années pour révéler la structure et la dynamique du microbiome végétal. Divers facteurs liés à l'hôte, aux microbes ainsi qu'à l'environnement influencent la composition et la diversité de ce microbiome. Cette revue visait à fournir un aperçu général des facteurs (hôte, microbe et environnement) qui déterminent la composition de la communauté microbienne dans les plantes. Tout d'abord, nous avons donné un aperçu des microbiomes végétaux aériens et souterrains. Ensuite, nous avons discuté des facteurs hôtes impliqués dans la variation chez les plantes, suivis de l'importance des interactions entre microbes et des éléments de l'environnement qui influencent la composition et la structuration communautaire des microbiomes végétaux.