Analyse comparative des communautés microbiennes habitant les évaporites de halite du désert d'Atacama.

RÉSUMÉ : Des techniques de biologie moléculaire et de microscopie ont été utilisées pour caractériser les communautés microbiennes à l'intérieur des évaporites de halite provenant de différentes parties du désert d'Atacama. L'analyse par électrophorèse en gel à gradient dénaturant (DGGE) a révélé que les roches évaporites abritent des communautés principalement composées de cyanobactéries, ainsi que de bactéries hétérotrophes et d'archées. Différents profils DGGE ont été obtenus pour les différents sites, à l'exception du profil cyanobactérien, dans lequel seul un phylotype a été détecté à travers les trois sites examinés. Les cellules de type Chroococcidiopsis étaient les seuls composants cyanobactériens des échantillons de roche, bien que l'étude phylogénétique ait révélé leur plus grande affinité génétique avec les genres Halothece. Les séquences géniques des bactéries hétérotrophes et des archées indiquaient leur proximité avec des micro-organismes trouvés dans d'autres environnements hypersalins. Les micro-organismes colonisant ces halites ont formé des agrégats microbiens dans les espaces poreux entre les cristaux de halite, où se produisent des interactions microbiennes. Dans cet habitat rocheux de halite exceptionnel, salé et poreux, des consortiums microbiens avec une structure communautaire probablement conditionnée par les conditions environnementales occupent des microhabitats particuliers avec des propriétés physiques et chimiques qui favorisent leur survie.