Visualisation de l'évolution des tumeurs avec le package fishplot pour R

CONTEXTE : Le séquençage massif parallèle en profondeur permet désormais de caractériser l'hétérogénéité et l'évolution des tumeurs avec un détail sans précédent. Le suivi de ces changements dans l'architecture clonale fournit souvent un aperçu de la réponse et de la résistance thérapeutiques. Dans des cas complexes impliquant plusieurs points temporels, les visualisations standard, telles que les nuages de points, peuvent être difficiles à interpréter. Les méthodes actuelles de visualisation des données sont également généralement manuelles et laborieuses, et approximatives des fractions subclonales. RÉSULTATS : Nous avons développé un package R qui affiche de manière précise et intuitive les changements dans la structure clonale au fil du temps. Il nécessite des données d'entrée simples et produit des graphiques illustratifs et faciles à interpréter, adaptés au diagnostic, à la présentation et à la publication. CONCLUSIONS : La simplicité, la puissance et la flexibilité de cet outil en font un atout précieux pour visualiser l'évolution des tumeurs, avec un potentiel d'utilité tant en recherche qu'en milieu clinique. Le package fishplot est disponible sur https://github.com/chrisamiller/fishplot.