Alignement multiple de génomes à l'ère de l'assemblage telomère-à-telomère

Avec l'arrivée des assemblages telomère-à-telomère (T2T) du génome humain, se pose le défi computationnel de construire des alignements multiples de génomes de manière efficace et précise à une échelle sans précédent. En identifiant les nucléotides à travers les génomes qui partagent un ancêtre commun, les alignements multiples de génomes servent souvent de socle pour les études de génomique comparative. Dans cette revue, nous proposons un aperçu du modèle algorithmique que suivent la plupart des méthodes d'alignement multiple de génomes. Nous discutons également des domaines d'amélioration prospective de l'alignement multiple de génomes afin de suivre l'arrivée continue de génomes assemblés T2T de haute qualité et de révéler des insights cliniquement pertinents.