Les glycols de 2′-désoxycytidine, un lien manquant dans l'oxydation de l'ADN médiée par les radicaux libres

Les glycols de 2-désoxycytidine (5,6-dihydroxy-5,6-dihydro-2-désoxycytidine) sont des produits majeurs de l'oxydation de la 2-désoxycytidine induite par les radicaux hydroxyles, résultant soit d'une réaction de Fenton, soit d'une exposition à des radiations ionisantes. En raison de leur instabilité, cependant, ces glycols n'ont pas été précédemment caractérisés. Au lieu de cela, l'accent a été mis sur les produits de décomposition principaux des glycols de 2-désoxycytidine, qui incluent 5-hydroxy-2-désoxycytidine, 5-hydroxy-2-désoxyuridine et les glycols de 2-désoxyuridine. Ici, nous avons identifié l'un des quatre diastéréoisomères possibles des glycols de 2-désoxycytidine par des analyses de produits de décomposition, de la RMN 1H et de la spectrométrie de masse. Ce glycol a été observé à se décomposer avec une demi-vie de 50 min à 37 °C dans des solutions neutres tamponnées et à subir préférentiellement une déshydratation pour former du 5-hydroxy-2-désoxycytidine. Le taux de décomposition dépendait fortement du pH (2-10) et de la concentration en ions phosphate (10 -300 mM). Ensuite, nous rapportons la déamination des glycols de cytosine en glycols d'uracile dans l'ADN oxydé en utilisant l'hydrolyse acide et l'analyse par chromatographie liquide à haute performance avec détection électrochimique pour surveiller le 5-hydroxycytosine et le 5-hydroxyuracile. Les résultats ont montré que la durée de vie des glycols de cytosine est considérablement augmentée dans l'ADN (34 fois ; demi-vie, 28 h), et que la déamination représente au moins un tiers de la décomposition totale. La durée de vie relativement longue des glycols de cytosine dans l'ADN suggère que cette importante classe de produits d'oxydation de l'ADN sera significativement impliquée dans les processus de réparation et de mutagenèse.