Une méthode pour évaluer la significativité statistique des identifications de protéines par spectrométrie de masse utilisant des schémas de score généraux

Cet article examine l'utilisation des fonctions de survie et des valeurs d'attente pour évaluer les résultats des expériences d'identification de protéines. Ces fonctions sont des mesures statistiques standard qui peuvent être utilisées pour réduire divers schémas de score d'identification de protéines à une représentation commune et facilement interprétable. Les mérites relatifs des systèmes de score ont été explorés en utilisant cette approche, ainsi que les effets des modifications des paramètres d'identification principaux. Nous préconisons l'utilisation généralisée de ces simples mesures statistiques pour simplifier et standardiser le rapport de la confiance des résultats d'identification de protéines, permettant aux utilisateurs de différents algorithmes d'identification de comparer leurs résultats de manière directe et statistiquement significative. Une méthode est décrite pour mesurer ces distributions en utilisant des informations qui sont rejetées par la plupart des moteurs de recherche d'identification de protéines, aboutissant à des fonctions de survie précises qui sont spécifiques à toute combinaison d'algorithmes de score, de bases de données de séquences et de spectres de masse.