Le nouveau paradigme du séquençage par cellule de flux : Tableau 1.

Le séquençage de l'ADN est en période de changements rapides, où le séquençage capillaire n'est plus la technologie de choix pour la plupart des applications à ultra-haut débit. Une nouvelle génération d'instruments qui utilise la synthèse amorcée dans des cellules de flux pour obtenir, simultanément, la séquence de millions de différents modèles d'ADN a transformé le domaine. Nous comparons et contrastons ces nouvelles plateformes de séquençage en termes d'étape de développement, de configuration instrumentale, de format de modèle, de chimie de séquençage, de capacité de rendement, de coût d'exploitation, de problèmes de gestion des données et de modèles d'erreur. Bien que ces plateformes surpassent les instruments capillaires en termes de bases par jour et de coût par base, la courte longueur des lectures de séquence obtenues à partir de la plupart des instruments et le nombre limité d'échantillons pouvant être analysés simultanément imposent certaines contraintes pratiques sur les applications de séquençage. Cependant, des méthodes récemment développées pour le séquençage à extrémités appariées et pour la sélection directe basée sur des matrices des modèles souhaités à partir de mélanges complexes étendent l'utilité de ces plateformes pour l'analyse génomique. Étant donné la demande toujours croissante d'informations sur les séquences d'ADN, nous pouvons nous attendre à une amélioration continue de cette nouvelle génération d'instruments et à leur remplacement éventuel par des technologies encore plus puissantes.