Aperçu et utilisation du Thésaurus NCI

Le Thésaurus NCI est une terminologie de référence couvrant des domaines de la science fondamentale et clinique, conçu dans le but de faciliter la recherche translationnelle en cancérologie. Il contient près de 110 000 termes regroupés en environ 36 000 concepts, répartis en 20 sous-domaines, qui incluent les maladies, les médicaments, l'anatomie, les gènes, les produits géniques, les techniques et les processus biologiques, entre autres, tous avec un contenu axé sur le cancer, et à l'origine conçu pour soutenir les activités de codage à travers l'Institut National du Cancer. Chaque concept représente une unité de sens et contient un certain nombre d'annotations, telles que des synonymes et un nom préféré, ainsi que des annotations telles que des définitions textuelles et des références optionnelles à des autorités externes. De plus, les concepts sont modélisés avec une logique de description (DL) et définis par leurs relations avec d'autres concepts ; il y a actuellement environ 90 types de relations nommées déclarées dans la terminologie. Le Thésaurus NCI est produit par le projet Enterprise Vocabulary Services, un effort collaboratif entre le Centre de Bioinformatique du NCI et le Bureau des Communications du NCI, et fait partie de l'infrastructure caCORE (http://ncicb.nci.nih.gov/NCICB/core). Il peut être accessible de manière programmatique via l'API caBIO ouverte et consulté sur le web (http://nciterms.nci.nih.gov). Un historique des modifications d'édition est également accessible via l'API. En outre, le Thésaurus est disponible en téléchargement dans divers formats de fichier, y compris OWL, le langage d'ontologie web, pour faciliter son utilisation par d'autres.