Diversité bactérienne dans le bacterioneuston (microlayer de surface de mer) : le bacterioneuston à travers le miroir

Le bacterioneuston est défini comme la communauté de bactéries présente au sein du neuston ou du microlayer de surface de mer. Les bactéries de cette couche ont été échantillonnées en utilisant une technique de filtration par membrane et la diversité bactérienne a été comparée à celle des eaux côtières pélagiques sous-jacentes à l'aide de techniques écologiques moléculaires. Des bibliothèques de gènes 16S rRNA d'environ 500 clones ont été construites à partir des échantillons de bacterioneuston et d'eau pélagique, et des clones représentatifs de chaque bibliothèque ont été séquencés pour la comparaison de la diversité bactérienne. Le bacterioneuston a montré une diversité bactérienne nettement inférieure à celle de l'eau pélagique, avec seulement neuf types de clones (écotaxons) contre 46 écotaxons dans la bibliothèque d'eau pélagique. Étonnamment, la bibliothèque de clones du bacterioneuston était dominée par des séquences de gènes 16S rRNA affiliées à deux groupes d'organismes, Vibrio spp. qui représentaient plus de 68 % des clones et Pseudoalteromonas spp. représentant 21 % de la bibliothèque. La dominance de ces deux types de séquences de gènes 16S rRNA au sein de la bibliothèque de clones du bacterioneuston a été confirmée lors d'une expérience ultérieure de sondage de gènes. Des sondes de gènes 16S rRNA spécifiques à ces groupes de bactéries ont été conçues et utilisées pour sonder de nouvelles bibliothèques de 1000 clones à partir des échantillons ADN de bacterioneuston et d'eau pélagique. Cela a révélé que 57 % des clones de la bibliothèque de bacterioneuston hybridaient avec une sonde de gène 16S rRNA spécifique à Vibrio sp. et 32 % hybridaient avec une sonde de gène 16S rRNA spécifique à Pseudoalteromonas sp. En revanche, la bibliothèque d'eau pélagique a résulté en seulement 13 % et 8 % des clones de gènes 16S rRNA hybrides avec les sondes respectives de Vibrio sp. et Pseudoalteromonas sp. Les résultats de cette étude suggèrent que le bacterioneuston contient une population distincte de bactéries et mérite des études détaillées supplémentaires au niveau moléculaire.