L'ensemble complet des espèces de tRNA dans Nanoarchaeum equitans

Le parasite archéal Nanoarchaeum equitans a été trouvé pour générer cinq espèces de tRNA via un processus unique nécessitant l'assemblage de moitiés de tRNA 5' et 3' séparées Randau, L., Munch, R., Hohn, M.J., Jahn, D. et Soll, D. (2005) Nanoarchaeum equitans crée des tRNA fonctionnels à partir de gènes séparés pour leurs moitiés 5'- et 3'-. Nature 433, 537-541. Une preuve biochimique manquait pour l'un des tRNA joint prédit par ordinateur désigné comme tRNA(Trp). Nos résultats de RT-PCR et de séquençage identifient ce tRNA comme tRNA(Lys) (CUU) joint à la position alternative entre les bases 30 et 31. Nous montrons que le tRNA(Trp) contenant un intron a été mal identifié dans l'annotation génomique initiale de Nanoarchaeum equitans E. Waters et al. (2003) Le génome de Nanoarchaeum equitans : perspectives sur l'évolution archéale précoce et le parasitisme dérivé. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 100, 12984-12988. Avec un tRNA(J) joint précédemment non identifié (UUG), Nanoarchaeum equitans présente 44 tRNAs et est capable de lire les 61 codons à sens. Les caractéristiques uniques de cet ensemble de molécules de tRNA sont discutées.