Preuves que les précurseurs de microARN, contrairement à d'autres ARN non codants, ont des énergies de repliement libre inférieures à celles des séquences aléatoires

Résumé Motivation : La plupart des ARN non codants se caractérisent par une structure secondaire et tertiaire spécifique qui détermine leur fonction. Ici, nous investiguons l'énergie de repliement de la structure secondaire des séquences d'ARN non codants, telles que les précurseurs de microARN, les ARN de transfert et les ARN ribosomiques dans plusieurs taxa eucaryotes. Les biais statistiques sont évalués par un test de randomisation, dans lequel l'énergie libre de repliement minimale prédite est comparée aux valeurs obtenues pour des structures inférées en mélangeant aléatoirement les séquences originales. Résultats : Contrairement aux ARN de transfert et aux ARN ribosomiques, la majorité des séquences de microARN présentent clairement une énergie libre de repliement considérablement inférieure à celle des séquences mélangées, indiquant une forte tendance dans la séquence vers une structure secondaire stable. Un usage possible de ce test statistique dans le cadre de la détection de véritables séquences de miARN est discuté. Disponibilité : L'ensemble de données, le logiciel et les fichiers de données supplémentaires sont disponibles gratuitement comme informations supplémentaires sur notre site Web. Informations supplémentaires : http://www.psb.ugent.be/bioinformatics/