Séquençage de l'exome : rôle dual en tant qu'outil de découverte et de diagnostic

Les développements récents dans les méthodes de capture de séquences à haut débit et les technologies de séquençage de nouvelle génération ont désormais rendu le séquençage de l'exome une approche viable pour élucider la base génétique des troubles mendéliens ayant une étiologie jusqu'alors inconnue. De plus, le séquençage de l'exome est de plus en plus utilisé comme outil de diagnostic pour des maladies génétiques spécifiques, en particulier dans le contexte de ces troubles caractérisés par une hétérogénéité génétique et phénotypique significative, par exemple, la maladie de Charcot-Marie-Tooth et les troubles congénitaux de la glycosylation. De tels troubles sont difficiles à interroger avec les méthodes conventionnelles de séquençage par PCR-Sanger, en raison de la difficulté inhérente à prioriser les gènes candidats pour les tests diagnostiques. Ici, nous explorons la valeur du séquençage de l'exome en tant qu'outil de diagnostic et discutons de la possibilité que le séquençage de l'exome puisse servir un double rôle dans le diagnostic et la découverte. Nous résumons l'état actuel du séquençage de l'exome, les défis techniques auxquels il est confronté, et son adaptation à la diagnostic, tout en formulant des recommandations pour l'utilisation du séquençage de l'exome comme un outil de diagnostic de routine. Enfin, nous discutons des préoccupations éthiques pertinentes, telles que l'utilisation des données de séquençage de l'exome, initialement générées dans un contexte diagnostique, dans des enquêtes de recherche.