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Nous présentons ici jmzML, une API Java pour la norme de données mzML de l'Initiative des Normes en Protéomique. Basé sur l'Architecture Java pour le Liaison XML et un indexeur XML basé sur XPath, le parseur XML à accès aléatoire jmzML peut gérer des fichiers de taille arbitraire avec une utilisation mémoire minimale, permettant un traitement facile et efficace des fichiers mzML en utilisant le langage de programmation Java. jmzML résout également automatiquement les références XML internes à la volée. La bibliothèque (qui inclut un visualiseur) peut être téléchargée sur http://jmzml.googlecode.com.
Côté et al. (Mon,) ont étudié cette question.