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Le concept d'espèce est une question controversée récurrente qui préoccupe les philosophes ainsi que les biologistes de toutes les disciplines. Le concept d'espèce procaryote a sa propre histoire et résulte d'une série d'améliorations empiriques parallèles au développement des techniques d'analyse. Parmi les taxonomistes microbiens, il y a un consensus général selon lequel le concept d'espèce actuellement en usage est utile, pragmatique et universellement applicable au sein du monde procaryote. Cependant, ce concept conçu empiriquement n'est englobé par aucun des 22 concepts décrits pour les eucaryotes. L'espèce pourrait être décrite comme 'un groupe monophylétique et génomiquement cohérent d'organismes individuels qui montrent un degré élevé de similarité globale dans de nombreuses caractéristiques indépendantes, et est identifiable par une propriété phénotypique discriminante'. Nous suggérons de l'appeler concept d'espèce phylo-phénotique. Ici, nous discutons de la validité du concept en usage que nous croyons être plus pragmatique par rapport à ceux décrits pour les eucaryotes.
Rosselló‐Móra et al. (Mon,) ont étudié cette question.