NBC : l'outil de classification Naïve Bayes serveur web pour la classification taxonomique des lectures métagénomiques

MOTIVATION : Les ensembles de données issus des technologies de séquençage à haut débit ont produit une quantité considérable de données sur les organismes dans les échantillons environnementaux. Cependant, il reste difficile d'évaluer le contenu exact en organismes de ces échantillons car la tâche de classification taxonomique est trop complexe sur le plan computationnel pour annoter toutes les lectures d'un ensemble de données. Un serveur web facile à utiliser est nécessaire pour traiter ces lectures. Bien que de nombreuses méthodes existent, seules quelques-unes sont disponibles au public sur des serveurs web, et parmi celles-là, la plupart n'annotent pas toutes les lectures. RÉSULTATS : Nous introduisons un serveur web qui implémente le classificateur naïf de Bayes (NBC) pour classer toutes les lectures métagénomiques dans leur meilleure correspondance taxonomique. Les résultats indiquent que le NBC peut associer des lectures de séquençage de nouvelle génération à leur classification taxonomique et peut trouver des populations significatives de genres que d'autres classificateurs peuvent manquer. DISPONIBILITÉ : Disponible publiquement à : http://nbc.ece.drexel.edu.