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Malgré le nombre croissant d'études de séquençage des répertoires immunitaires, le domaine manque encore de logiciels pour l'analyse et la compréhension de ces données à haute dimension. Nous rapportons ici VDJtools, une suite logicielle complémentaire qui résout un large éventail de tâches d'analyse postérieure des répertoires de récepteurs T (TCR), fournit des sorties tabulaires détaillées et des graphiques prêts à être publiés, et est construit sur une API flexible. En utilisant des ensembles de données TCR pour une grande cohorte de donneurs sains non apparentés, de jumeaux et de patients atteints de sclérose en plaques, nous démontrons que VDJtools facilite grandement l'analyse et conduit à des conclusions biologiques solides. Le logiciel VDJtools et sa documentation sont disponibles sur https://github.com/mikessh/vdjtools.
Shugay et al. (Mercredi,) ont étudié cette question.