CircaDB : une base de données des profils d'expression génique circadienne chez les mammifères

CircaDB (http://circadb.org) est une nouvelle base de données des profils de transcription circadienne provenant d'expériences d'expression au cours du temps sur des souris et des humains. L'expression de chaque transcript a été évaluée par trois algorithmes séparés : JTKCycle, Lomb Scargle et DeLichtenberg. Les utilisateurs peuvent interroger les annotations géniques en utilisant des termes de recherche en texte intégral simples et puissants, restreindre les résultats à des ensembles de données spécifiques et fournir des seuils de probabilité pour chaque algorithme. Les visualisations des données sont des graphiques intuitifs qui transmettent les informations de profil plus efficacement qu'un tableau de probabilités. L'application web CircaDB est open source et disponible sur http://github.com/itmat/circadb.