Expression Profiler : nouvelle génération - une plateforme en ligne pour l'analyse des données de microarrays

Expression Profiler (EP, http://www.ebi.ac.uk/expressionprofiler) est une plateforme web pour l'analyse des données d'expression génique de microarrays et d'autres données liées à la génomique fonctionnelle. La nouvelle architecture, Expression Profiler : nouvelle génération (EP:NG), modularise la conception originale et permet le développement de composants liés à des tâches d'analyse individuelles par différents groupes tout en fonctionnant de manière transparente ensemble et en partageant la même interface utilisateur. Des composants d'analyse de données pour le prétraitement des données d'expression génique, l'imputation des valeurs manquantes, le filtrage, les méthodes de clustering, la visualisation, la recherche de gènes significatifs, l'analyse entre groupes et d'autres composants statistiques sont disponibles sur le site web de l'EBI (Institut Européen de Bioinformatique). La conception web d'Expression Profiler soutient le partage de données et l'analyse collaborative dans un environnement sécurisé. Les outils développés sont intégrés à la base de données d'expression génique de microarrays ArrayExpress et forment le front-end analytique exploratoire pour ces données. EP:NG est un projet open source, encourageant une large distribution et des extensions ultérieures de la part de la communauté scientifique.