La protéomique multinationale révèle des signatures épigénétiques dans l'activation des macrophages médiée par le BCG

Le vaccin bacille Calmette-Guérin BCG (Mycobacterium bovis) est principalement utilisé pour prévenir les infections tuberculeuses (TB), mais a des effets immunogènes variés. L'une de ses propriétés les plus notables est sa capacité à induire une immunité entraînée, une réponse de type mémoire dans les cellules immunitaires innées telles que les macrophages. Grâce à des analyses ciblées des marques d'histones bien établies, des recherches antérieures ont montré que ces changements sont générés par une modification épigénétique. Les approches de protéomique basées sur la spectrométrie de masse fournissent un moyen de profiler globalement divers aspects du protéome, fournissant des données pour identifier davantage de mécanismes inexplorés de l'immunomodulation médiée par le BCG. Ici, nous utilisons la protéomique à plusieurs niveaux (totale, histone et phospho) pour identifier des réseaux et des mécanismes potentiels qui médiatisent l'immunomodulation induite par le BCG dans les macrophages. La protéomique axée sur les histones et la protéomique totale ont été réalisées à l'Université du Cap (données disponibles via ProteomeXchange avec l'identifiant PXD051187), tandis que les données de phosphoprotéomique ont été récupérées du dépôt ProteomeXchange (identifiant PXD013171). Nous identifions plusieurs mécanismes épigénétiques qui peuvent conduire à des phénotypes d'entraînement induits par le BCG. Les preuves à travers l'ensemble de données de protéomique et de protéomique axée sur les histones associent 6 effecteurs épigénétiques (NuA4, NuRD, NSL, Sin3A, SIRT2, SIRT6) et leurs substrats.