ARNm de l'apolipoprotéine E humaine. Clonage cDNA et séquençage des nucléotides d'une nouvelle variante.

Les séquences nucléotidiques complètes de trois cDNAs clonés correspondant à l'ARNm d'apolipoprotéine E (apo-E) du foie humain ont été déterminées. L'analyse du cDNA le plus long a montré qu'il contenait 1157 nucléotides de séquence d'ARNm avec une région non traduite à 5'-terminal de 61 nucléotides, une région de peptide signal correspondant à 18 acides aminés, une région de protéine mature correspondant à 299 acides aminés et une région non traduite à 3'-terminal de 142 nucléotides. Les séquences d'acides aminés déduites de deux cDNAs étaient identiques et correspondaient à la séquence d'acides aminés pour l'apo-E3 plasmatique qui a été rapportée précédemment (Rall, S. C., Jr., Weisgraber, K. H., et Mahley, R. W. (1982) J. Biol. Chem. 257, 4171-4178). Le troisième cDNA différait des deux autres cDNAs en cinq positions nucléotidiques. Trois de ces différences se produisaient dans la troisième position nucléotidique des codons d'acides aminés, entraînant aucun changement des acides aminés correspondants aux résidus Val-85, Ser-223 et Gln-248. Les deux autres nucléotides modifiés se trouvaient dans la première position nucléotidique des codons, ce qui entraînait des changements dans les acides aminés codés. Dans la séquence variante, une thréonine remplaçait l'alanine normale au résidu 99 et une proline remplaçait l'alanine normale au résidu 152. Nous avons conclu que le donneur du foie humain était hétérozygote pour le génotype epsilon 3. Le cDNA variant correspond à une nouvelle forme variante d'apo-E, précédemment non décrite, dans laquelle les substitutions d'acides aminés de la protéine sont électrophorétiquement silencieuses ; elle serait probablement indétectable par les méthodes standard de typage de l'apo-E. La substitution d'acide aminé à la position 152 se produit dans une région de l'apo-E qui semble être importante pour la liaison au récepteur, et cela peut avoir une signification clinique.