Cartographie d'association à l'échelle du génome de la résistance aux souches de la brûlure du riz en Chine du Sud et identification d'un nouvel allèle Pik

CONTEXT : Une gestion efficace de la brûlure du riz, causée par le champignon Magnaporthe oryzae, nécessite une compréhension de l'architecture génétique de la résistance à la maladie dans le riz. La résistance du riz varie selon les souches de M. oryzae, et de nombreux loci de traits quantitatifs (QTL) affectant la résistance à la brûlure du riz ont été cartographiés en utilisant différentes souches de M. oryzae provenant de différentes régions. Cependant, peu de choses sont connues sur l'architecture génétique de la résistance du riz contre la population de M. oryzae dans la province du Hunan, qui est une principale zone de production de riz en Chine du Sud. RÉSULTATS : Dans cette étude, nous avons utilisé trois isolats de la province du Hunan et le panneau de diversité du riz 1 pour effectuer une étude d'association à l'échelle du génome (GWAS) de la résistance à la brûlure dans le riz. Un total de 56 QTL ont été identifiés. Un des QTL est localisé avec le locus du gène de résistance Pik qui confère une résistance aux trois isolats. L'analyse de séquence génomique des cultivars résistants a conduit à l'identification d'un nouvel allèle Pik, que nous avons nommé Pikx. Des essais de double hybride de levure et de co-immunoprécipitation entre AvrPiks et Pikx ont confirmé que Pikx est un nouvel allèle au locus Pik. CONCLUSIONS : Notre GWAS a identifié de nombreux nouveaux QTL de résistance à la brûlure. Le nouvel allèle Pik identifié, Pikx, sera utile pour la sélection de cultivars avec une haute résistance à la brûlure dans le Hunan et d'autres provinces du sud de la Chine. Des recherches supplémentaires sur la relation entre AvrPiks et Pikx fourniront de nouvelles perspectives sur le mécanisme moléculaire de la résistance du riz à M. oryzae.