Distribution de la fréquence des allèles sous des balayages sélectifs récurrents

La fréquence de l'allèle d'une variante neutre dans une population est poussée vers le haut ou vers le bas par une sélection directionnelle sur une mutation bénéfique liée ("balayages sélectifs"). Les séquences d'ADN échantillonnées après la fixation de l'allèle bénéfique contiennent donc un excès d'allèles neutres rares. Cette étude examine la distribution de fréquence des allèles sous des modèles de balayage sélectif en utilisant une approximation analytique et une simulation. Tout d'abord, étant donné un seul balayage sélectif à un moment fixe, j'obtiens une expression pour les probabilités d'échantillonnage des mutants neutres. Cette solution peut être utilisée pour estimer le temps de fixation d'un allèle bénéfique à partir de données de séquence. Ensuite, j'obtiens une approximation des fréquences alléliennes moyennes sous des balayages sélectifs récurrents. Sous des balayages récurrents, le spectre de fréquence est biaisé vers des allèles rares. Cependant, l'excès d'allèles dérivés à haute fréquence, précédemment montré comme étant une signature de balayages sélectifs uniques, disparaît avec les balayages récurrents. Il est démontré qu'en utilisant cette approximation et des données de polymorphisme multilocus, les paramètres du génome concernant la sélection directionnelle peuvent être estimés.