Caractérisation des domaines C‐terminaux des facteurs de transcription de stress thermique d'Arabidopsis (Hsfs) et identification d'une nouvelle combinaison de signatures des Hsfs de classe A végétale avec des motifs AHA et NES essentiels pour la fonction d'activateur et la localisation intracellulaire

Les facteurs de transcription de stress thermique (Hsfs) sont les principaux régulateurs de la réponse au stress thermique (hs) des plantes. Le séquençage du génome d'Arabidopsis a révélé l'existence de 21 cadres de lecture ouverts (ORFs) codant des Hsfs putatifs assignés aux classes A-C. Ici, nous présentons les résultats d'une approche de génomique fonctionnelle de la famille Hsf d'Arabidopsis axée sur l'analyse de leurs domaines C-terminaux (CTDs) abritant des modules conservés pour leur fonction en tant que facteurs de transcription et leur localisation intracellulaire. En utilisant des essais de rapporteurs dans des protoplastes de tabac et de la levure ainsi que des essais de pull-down avec glutathion-S-transférase (GST), nous démontrons que de courts motifs peptidiques enrichis en acides aminés (aa) aromatiques et hydrophobes larges intégrés dans un environnement acide (motifs AHA) sont essentiels pour l'activité transcriptionnelle des Hsfs de classe A. En revanche, les Hsfs de classe B et C manquent de motifs AHA et n'ont pas de fonction d'activateur par eux-mêmes. Nous fournissons également des preuves pour la fonction d'une région riche en leucine (Leu) centrée autour d'un motif QMGPhiL conservé à l'extrême C-terminus comme signal d'export nucléaire (NES) des Hsfs de classe A. La comparaison des séquences indique que la combinaison d'un motif AHA C-terminal avec la séquence consensus FWxxF/L,F/I/L ainsi que le NES adjacent représente un domaine de signature pour les Hsfs de classe A végétale, ce qui a permis d'identifier plus de 60 nouveaux Hsfs à partir de la base de données des tags de séquence exprimés (EST).