Estimation de la richesse des espèces : Modèles de mélange, rôle des espèces rares et défis inférentiels

Nous examinons le rôle des espèces rares dans le problème de l'estimation de la richesse des espèces au sein de l'habitat basé sur des données d'échantillonnage. L'estimation de la richesse peut être modélisée de manière réaliste pour des données basées sur l'abondance et l'incidence en utilisant respectivement des mélanges de Poisson ou binomiaux. Le problème peut être réduit à l'estimation des cotes de la probabilité qu'une espèce reste non détectée dans l'échantillon ou l'ensemble d'échantillons. Dans ce cadre statistique rigoureux, nous explorons les méthodes existantes d'estimation de la richesse et évaluons leurs limites. Nous faisons cela en modélisant l'ajout d'un nombre croissant d'espèces rares et non détectées à un assemblage de référence, en évaluant la capacité de différentes méthodes à distinguer les assemblages d'espèces modifiés de l'assemblage de référence. (Nous utilisons des jeux de données d'exemples empiriques pour les oiseaux, les graines et les coléoptères comme assemblages de référence.) En considérant les contributions des espèces rares et le rôle des espèces non détectées pour un effort d'échantillonnage fixe, nous montrons pourquoi le problème de l'estimation de la richesse est si difficile, et nous discutons de ce que les modèles statistiques peuvent fournir.