Une plateforme de test de variétés pour la normalisation et l'amélioration de la qualité des données des tests de variétés de cultures

Le test de variétés est une étape indispensable et essentielle dans le processus de création de nouvelles variétés améliorées, de la sélection à l'adoption. La performance des variétés peut être comparée et évaluée sur la base de données multi-caractéristiques provenant de tests de variétés multi-localisations sur plusieurs années. Bien que des plateformes phénotypiques à haut débit aient été utilisées pour observer certains traits spécifiques, le phénotypage manuel est encore largement utilisé. La gestion efficace de grandes quantités de données constitue toujours un problème significatif pour les tests de variétés de cultures. Cette étude rapporte une plateforme de test de variétés (PTV) qui a été créée pour gérer l'ensemble du flux de travail pour la normalisation et l'amélioration de la qualité des données des tests de variétés de cultures. Grâce à la PTV, les données phénotypiques des variétés peuvent être intégrées et réutilisées sur la base d'éléments de données et de jeux de données normalisés. De plus, le support d'information et les fonctions automatisées pour l'ensemble du flux de travail de test aident les utilisateurs à mener des tests de manière efficace à travers une série de fonctions telles que la conception des tests, l'acquisition et le traitement des données, ainsi que les analyses statistiques. La PTV a été appliquée à des tests de variétés régionaux couvrant plus de sept mille emplacements dans tout le pays, et une base de données phénotypique normalisée et autoritaire couvrant cinq cultures a ensuite été générée. De plus, la PTV peut être déployée sur des nœuds de calcul haute performance soit privés, soit accessibles au public, de sorte que la gestion des tests et l'analyse des données puissent être effectuées de manière pratique à l'aide d'une interface web ou d'une application mobile. De cette manière, le système peut fournir des services de gestion de tests de variétés à davantage de petites et moyennes organisations de sélection, et assure l'indépendance mutuelle et la sécurité des données de test. L'application de la PTV montre que la plateforme peut rendre les tests de variétés plus efficaces et peut être utilisée pour générer une base de données fiable adaptée à la méta-analyse dans des projets de sélection et de développement de variétés multi-omiques.