Espacement des demi-sites palindromiques comme déterminant de la liaison sélective de l'ADN par les STAT (transducteurs de signaux et activateurs de transcription) et de l'activité transcriptionnelle.

Les transducteurs de signaux et activateurs de transcription (protéines STAT) se lient à des éléments de séquence palindromiques liés aux sites d'activation de l'interféron gamma (IFN-gamma), qui ont été identifiés pour la première fois dans les promoteurs des gènes inductibles par l'IFN-gamma. Bien que les séquences des éléments de liaison palindromiques à STAT naturels varient considérablement, elles se conforment à la structure générale TT(N)5AA. Nous avons examiné systématiquement les effets de l'espacement entre les demi-sites centraux TT et AA sur la liaison des complexes STAT activés par l'IFN-gamma, l'interleukine (IL) 6, le facteur de stimulation des colonies granulocyte-macrophage et l'IL-4. Nous montrons que (i) comme suggéré précédemment, un motif palindromique TT--AA avec un espacement de 5 pb affiche une liaison générale aux STAT, (ii) un motif palindromique avec un espacement de 4 pb se lie sélectivement à des complexes contenant Stat3, et (iii) un motif avec un espacement de 6 pb se lie sélectivement aux complexes STAT activés par l'IL-4. Nous avons examiné des éléments naturels dans les promoteurs des gènes réactifs aux cytokines qui diffèrent par l'espacement des demi-sites et avons constaté qu'ils affichent des propriétés de liaison prédites à partir des sites de liaison synthétiques. De plus, les caractéristiques de liaison sélective différentielle observées corrèlent dans une large mesure avec la capacité de médiatiser l'activation transcriptionnelle des gènes témoins transfectés en réponse aux cytokines testées. Nos résultats démontrent ainsi que la spécificité de la transcription dirigée par les STAT en réponse à des cytokines particulières ou familles de cytokines dépend en partie de l'espacement des demi-sites dans la séquence conservée de l'élément de réponse.