Détection de l'expression sélective des gènes et des protéines

L'expression sélective d'un produit génique (ARNm ou protéine) est un modèle dans lequel l'expression est nettement élevée, ou nettement basse, dans un tissu particulier par rapport à son niveau dans d'autres tissus ou sources. Nous présentons une méthode computationnelle pour l'identification de tels motifs. La méthode combine des évaluations de la fiabilité de la quantification de l'expression avec un test statistique des modèles de distribution de l'expression. La méthode est applicable à de petites études ou à l'exploration des données d'abondance provenant de bases de données d'expression, que ce soit pour l'ARNm ou les protéines. Bien que la méthode ait été développée à l'origine pour des analyses d'expression génique, la méthode computationnelle est en réalité plutôt générale. Elle est bien adaptée pour l'identification de valeurs exceptionnelles dans de nombreux types de données d'intensité, même des données bruyantes, pour lesquelles des évaluations de confiance dans les sources des intensités sont disponibles. De plus, la méthode est indifférente quant à savoir si les intensités sont dérivées expérimentalement ou computationnellement. Nous montrons les détails de la méthode générale et des exemples de résultats computationnels sur des données d'abondance génique.