Comprendre les dynamiques de transmission du virus respiratoire syncytial à l'aide de séries temporelles multiples et de modèles imbriqués

La nature et le rôle de la réinfection et de l'immunité partielle sont probablement des déterminants importants des dynamiques de transmission du virus respiratoire syncytial humain (hRSV). Nous proposons une structure de modèle unique qui capture quatre réponses possibles de l’hôte à l'infection et à la réinfection subséquente : susceptibilité partielle, durée d'infection modifiée, infectiousness réduite et immunité temporaire (qui pourrait être partielle). L'ampleur de ces réponses est déterminée par quatre paramètres d'homotopie, et en fixant certains de ces paramètres à des valeurs extrêmes, nous générons un ensemble de huit modèles de transmission déterministes imbriqués. Afin d'étudier les dynamiques de transmission de l'hRSV, nous avons appliqué ces modèles à des données d'incidence provenant de huit localisations internationales. La saisonnalité est incluse comme variation cyclique dans la transmission. Les paramètres associés à l'histoire naturelle de l'infection étaient supposés être indépendants de la localisation géographique, tandis que d'autres, tels que ceux associés à la saisonnalité, étaient supposés spécifiques à la localisation. Les modèles incorporant l'une ou l'autre des deux hypothèses extrêmes concernant l'immunité (aucune ou solide et à vie) n'étaient pas en mesure de reproduire les dynamiques observées. Les ajustements de modèle avec une immunité déclinante ou partielle à la maladie ou les deux étaient visuellement comparables. La structure d'ajustement la plus performante était une immunité partielle à vie tant à la maladie qu'à l'infection. Les modèles stochastiques utilisant les valeurs de paramètres estimées à partir des modèles déterministes ont reproduit les schémas observés.