Métagénomique pour la découverte de nouveaux virus humains

Des techniques de laboratoire modernes pour la détection de nouveaux virus humains sont grandement nécessaires alors que les médecins et les épidémiologistes sont de plus en plus confrontés à des maladies infectieuses causées par de nouveaux agents pathogènes ou des agents auparavant non reconnus. De nombreux syndromes cliniques soupçonnent un rôle des virus, mais pour lesquels les techniques de microbiologie traditionnelle échouent régulièrement à identifier l'agent étiologique. De plus, de nouveaux virus continuent de représenter un défi pour la population humaine en raison de l'empiètement des établissements humains dans les habitats d'animaux et de bétail, de la mondialisation, du changement climatique, de l'augmentation du nombre de personnes immunodéprimées et du bioterrorisme. Les outils basés sur la métagénomique, tels que les microarrays et le séquençage à haut débit, sont idéaux pour répondre à ces défis. Les microarrays pan-viraux, contenant des séquences représentatives de tous les virus connus, ont été utilisés pour détecter de nouveaux variants et des variants éloignés de virus connus. Les méthodes basées sur le séquençage ont également été utilisées avec succès pour détecter de nouveaux virus et ont le potentiel de détecter l'ensemble du spectre des virus, y compris ceux présents en faible quantité.