Le site web TP53 : un centre de ressources intégratif pour la base de données des mutations TP53 et l'analyse des mutants TP53

Un nouveau centre de ressources pour les mutations et mutants TP53 a été développé (http://p53.fr). La dysfonction du gène TP53 peut être trouvée dans la majorité des types de cancer humain. L'utilisation potentielle de la mutation TP53 comme biomarqueur pour les études cliniques ou l'analyse de l'exposome a conduit à la publication de milliers de rapports décrivant l'état du gène TP53 dans plus de 10 000 tumeurs. La base de données des mutations TP53 de l'UMD a été créée en 1990 et a été régulièrement mise à jour. La version 2012 de la base de données a été soigneusement curée, et tous les rapports suspects ont été éliminés. Elle est disponible soit sous forme de fichier plat facilement manipulable, soit sous forme d'un nouveau logiciel d'analyse multiplateforme conçu pour analyser divers aspects des mutations TP53. Plusieurs outils pour déterminer les mutations TP53 sont également disponibles en téléchargement. Nous avons développé TP53MULTLoad, une base de données soigneusement réalisée fournissant des détails complets sur les caractéristiques de 2549 mutants TP53 de type missense. Plus de 100 000 entrées ont été organisées dans 39 champs d'activité différents, tels que le changement de transactivation sur différents promoteurs, l'apoptose ou l'arrêt de croissance. Pour plusieurs mutants à points chauds, plusieurs activités de gain de fonction sont également incluses. La base de données peut être facilement consultée via une interface graphique.