Mesures de similarité sémantique comme outils pour explorer l'ontologie des gènes

De nombreuses ressources en bioinformatique contiennent des données sous forme de séquences. Souvent, ces données de séquences sont associées à une grande quantité d'annotation. Dans de nombreux cas, ces données ont été difficiles à modéliser et ont été représentées sous forme de langage naturel scientifique, ce qui n'est pas facilement exploitable sur le plan computationnel. Le développement de l'ontologie des gènes nous fournit une représentation plus accessible de certaines de ces données. Cependant, il n'est pas clair comment ces données peuvent être recherchées ou interrogées de la meilleure manière. Récemment, nous avons adapté des mesures basées sur le contenu informatif pour les utiliser avec l'ontologie des gènes (GO). Dans cet article, nous présentons une enquête détaillée des propriétés de ces mesures et examinons diverses propriétés de la GO, qui peuvent avoir des implications pour sa conception future.