La réponse au signal de IκBα est régulée par des domaines N- et C-terminaux transférables

IκBα retient le facteur de transcription NF-κB dans le cytoplasme, inhibant ainsi sa fonction. Divers stimuli inactivent IκBα en déclenchant la phosphorylation des résidus N-terminaux Ser32 et Ser36. La phosphorylation des deux sérines est démontrée directement par le mapping des phosphopetides utilisant la protéase calpaïne, qui coupe environ 60 résidus depuis le N-terminus, et par l'analyse de mutants manquant un ou les deux résidus de sérine. La phosphorylation est suivie d'une protéolyse rapide, et le NF-κB libéré se transloque vers le noyau, où il active la transcription de ses gènes cibles. Le transfert du domaine N-terminal de IκBα vers le domaine ankyrine de l'oncoprotéine apparentée Bcl-3 ou vers la protéine non apparentée glutathione S-transférase confère une phosphorylation induite par le signal sur les protéines chimériques résultantes. Si le domaine C-terminal de IκBα est également transféré, les chimères résultantes présentent à la fois une phosphorylation induite par le signal et une protéolyse rapide. Ainsi, la réponse au signal de IκBα est contrôlée par des domaines N-terminaux et C-terminaux transférables.