Les longs ARN non codants cytoplasmiques sont fréquemment liés aux ribosomes et dégradés dans les cellules humaines

Des études récentes de footprinting ont fait l'observation surprenante que les longs ARN non codants (lncARN) interagissent physiquement avec les ribosomes. Cependant, ces résultats demeurent controversés, et la proportion globale de lncARN cytoplasmiques impliqués est inconnue. Ici, nous faisons une estimation globale et absolue de la population d'lncARN cytoplasmiques et associées aux ribosomes dans une lignée cellulaire humaine en utilisant le profilage des polysomes couplé à l'analyse de microarray normalisée par ajout. Cinquante-quatre pour cent des lncARN exprimés sont détectés dans le cytoplasme. La majorité d'entre eux (70%) ont plus de 50% de leurs copies cytoplasmiques associées à des fractions polysomales. Ces interactions sont perdues lors de la disruption des ribosomes par la puromycine. Les lncARN polysomaux se distinguent par un certain nombre de caractéristiques similaires aux ARN messagers en 5', y compris une coiffe et une longueur de 5'UTR. En revanche, les lncARN "cytoplasmiques libres" non polysomaux ont des promoteurs plus conservés et une gamme d'expression plus large à travers les types cellulaires. Les exons des lncARN polysomaux sont dépourvus d'insertion rétrovirale endogène, suggérant un rôle pour les éléments répétitifs dans la localisation des lncARN. Enfin, nous montrons que le blocage de l'élongation ribosomale entraîne la stabilisation de nombreux lncARN associés. Ensemble, ces résultats suggèrent que le ribosome est la destination par défaut pour la majorité des longs ARN non codants cytoplasmiques et peut jouer un rôle dans leur dégradation.