L'acidification intracellulaire par l'acide valérique dérivé du microbiote facilite l'écologie trans-royaume limitant la colonisation de Candida parapsilosis

Chez les patients ayant reçu une greffe de cellules hématopoïétiques (HCT), l'expansion et la translocation intestinales de Candida parapsilosis peuvent entraîner une candidémie mettant la vie en danger, mais il reste à définir si les bactéries intestinales commensales empêchent l'expansion de Candida. Ici, nous avons entraîné un modèle d'apprentissage machine sur les profils métabolomiques des surnageants de Lachnospiraceae pour identifier des inhibiteurs dérivés de bactéries de la croissance fongique, identifiant les acides valérique et butyrique comme principaux candidats. Les échantillons fécaux de patients HCT ont soutenu cette association, les niveaux d'acide valérique et d'acide butyrique corrélant inversement avec la croissance de C. parapsilosis. Dans des cultures cellulaires et chez des souris, l'acide valérique a inhibé la croissance de C. parapsilosis en augmentant l'acidification intracellulaire. L'administration de valérate de glycéryle, ou d'acide valérique libre ou microencapsulé, pour libérer de l'acide valérique tout au long du tractus intestinal a atténué la croissance de C. parapsilosis aux sites intestinaux murins où l'acide valérique a été détecté. Ainsi, l'apprentissage machine a identifié un facteur mécaniste de l'écologie trans-royaume limitant l'expansion intestinale de C. parapsilosis et pourrait informer des stratégies pour réduire le risque de candidose chez les patients.