Phylogénétique mitochondriale et évolution des baleines mysticètes

Les relations phylogénétiques parmi les baleines à fanons (Ordre : Cétacés) demeurent incertaines malgré des recherches approfondies en phylogénétique moléculaire des cétacés et un potentiel échantillon morphologique de plus de 2 millions d'animaux récoltés. Des questions subsistent concernant le nombre d'espèces et la monophylie des genres, ainsi que les relations d'ordre supérieur. Ici, nous abordons la phylogénie des mysticètes par une analyse complète des séquences du génome mitochondrial. Nous avons déterminé des séquences complètes de l'ADN mitochondrial de 10 espèces de Mysticeti existantes, inféré leurs relations phylogénétiques et estimé les temps de divergence des nœuds. L'analyse des séquences d'ADN mitochondrial concorde avec les études moléculaires précédentes dans l'ordre des principales branches, avec Balaenidae (baleines frémissantes) comme sœur de tous les autres mysticètes, suivie des Neobalaenidae (baleine frémissante pygmée), des Eschrichtiidae (baleine grise), et enfin des Balaenopteridae (rorquals + baleine à bosse). L'analyse de l'ADN mitochondrial suggère en outre que quatre lignées existent au sein du clade de Eschrichtiidae + Balaenopteridae, y compris une relation sœur entre les baleines à bosse et les baleines de Fins, ainsi qu'un groupe monophylétique formé par les baleines bleues, les baleines de Sei et les baleines de Bryde, chacune représentant une relation phylogénétique nouvellement reconnue chez Mysticeti. Nous avons également estimé les temps de divergence de toutes les espèces de mysticètes existantes, en tenant compte de l'hétérogénéité du taux d'évolution parmi les lignées. Lorsque les estimations de divergence de l'ADN mitochondrial sont comparées au registre fossile des mysticètes, plusieurs lignées présentent des estimations de divergence moléculaire remarquablement plus anciennes que celles indiquées par les données paléontologiques. Nous suggérons que cette discorde reflète à la fois une grande quantité de polymorphisme ancestral et de longs temps de génération des populations ancestrales de baleines à fanons.