Quantification sérielle de l'ADN libre de cellules microbiennes plasmatiques avant et après le diagnostic des infections fongiques invasives pulmonaires après transplantation de cellules hématopoïétiques

CONTEXTE : Le séquençage de l'ADN libre de cellules microbiennes plasmatiques (mcfDNA-Seq) est un test non invasif pour le diagnostic microbien des infections fongiques invasives (IMI). L'utilité de mcfDNA-Seq pour prédire l'apparition d'IMI et les implications cliniques des concentrations de mcfDNA sont inconnues. MÉTHODES : Nous avons testé rétrospectivement le plasma de receveurs de transplantation de cellules hématopoïétiques (HCT) avec IMI pulmonaires et ≥1 champignon identifié par mcfDNA-Seq dans le plasma prélevé dans les 14 jours suivant le diagnostic clinique. Des échantillons prélevés jusqu'à 4 semaines avant et 4 semaines après le diagnostic d'IMI ont été évalués à l'aide de mcfDNA-Seq. RÉSULTATS : Trente-cinq receveurs de HCT avec 39 IMI (16 infections à Aspergillus et 23 infections non Aspergillus) ont été inclus. Des moisissures pathogènes ont été détectées dans 38 %, 26 %, 11 % et 0 % des échantillons prélevés respectivement pendant la première, la deuxième, la troisième et la quatrième semaine avant le diagnostic clinique. Dans les infections non-Aspérgillus, les concentrations médianes de mcfDNA dans les échantillons prélevés dans les 3 jours suivant le diagnostic clinique étaient plus élevées dans les infections avec propagation extrapulmonaire par rapport à celles sans propagation (4.3 vs 3.3 log10 molécules par microlitre mpm, P = .02), et tous les patients (8/8) avec des concentrations de mcfDNA > 4.0 log10 mpm sont décédés dans les 42 jours suivant le diagnostic clinique. CONCLUSIONS : Le mcfDNA-Seq plasmatique peut identifier des moisissures pathogènes jusqu'à 3 semaines avant le diagnostic clinique d'IMI pulmonaire. Les concentrations de mcfDNA plasmatique peuvent corréler avec la propagation extrapulmonaire et la mortalité dans les IMI non-Aspergillus.