Cibles directes et indirectes du facteur de transcription des graines d'Arabidopsis ACIDE ABSCISIQUE INSENSIBLE3

Arabidopsis thaliana ACIDE ABSCISIQUE INSENSIBLE3 (ABI3) est un facteur de transcription de la famille des domaines B3. ABI3, ainsi que les facteurs de transcription à domaine B3 LEAFY COTYLEDON2 (LEC2) et FUSCA3 (FUS3), et LEC1, une sous-unité du complexe de liaison au boîtier CCAAT, forment le réseau LAFL, dit, pour contrôler divers aspects du développement et de la maturation des graines. ABI3 contribue également à la réponse à l'acide abscissique (ABA). Nous rapportons des expériences de chromatin immunoprecipitation-tiling array pour cartographier les sites de liaison pour ABI3 à l'échelle globale. Nous avons également évalué les transcriptomes en réponse à ABI3 en comparant des graines en développement abi3-5 et de type sauvage et avons combiné ces informations pour déterminer les gènes cibles d'ABI3 réactifs directs et indirects. ABI3 peut induire et réprimer sa transcription de gènes cibles directement et certaines différences intéressantes existent dans les motifs cis entre ces groupes de gènes. Les cibles régulées directement reflètent le rôle d'ABI3 dans la maturation des graines, la tolérance à la dessiccation, l'entrée dans un état quiescent et la longévité. Fait intéressant, ABI3 réprime directement un gène codant un microARN (MIR160B) qui cible AUXIN RESPONSE FACTOR (ARF)10 et ARF16, impliqués dans l'établissement de la dormance. De plus, ABI3, comme FUS3, régule les gènes codant MIR156, mais tandis que FUS3 induit uniquement les gènes codant ce produit, ABI3 induit ces gènes lors des premières étapes du développement des graines, mais les réprime lors du développement tardif. Les interactions entre ABI3, les autres gènes LAFL, et les gènes VP1/ABI3-LIKE (VAL), qui sont impliqués dans la transition vers le développement des plantules, sont examinées et révèlent des interactions complexes contrôlant le développement.