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L'ADN simple brin dans l'ESDSA nécessite la fonction d'au moins une nuclease et une hélicase, et peut-être plusieurs des deux. Des protéines sont également nécessaires pour charger la protéine RecA sur l'ADN simple brin revêtue de protéine de liaison à l'ADN simple brin (SSB). La voie la plus importante pour la réparation des cassures à double brin chez Escherichia coli utilise l'enzyme RecBCD pour tous ces rôles. Cependant, Deinococcus ne code pas d'homologue de RecB ou RecC. Deinococcus code des homologues de chaque protéine impliquée dans ce qui est considéré (dans E. coli) comme une voie auxiliaire pour la réparation de l'ADN par recombinaison—la voie RecFOR. Dans la voie RecFOR, les protéines RecJ et RecQ assument respectivement les rôles de nuclease et d'hélicase, tandis que les protéines RecFOR fonctionnent pour charger RecA.
Cox et al. (Thu,) ont étudié cette question.