La transcription est organisée spatialement dans le noyau, concentrant les facteurs de transcription, les coactivateurs et l'ARN polymérase II dans des compartiments dynamiques sans membrane. De telles assemblées ont été décrites de nombreuses manières, allant de petits complexes de stœchiométrie définie à des condensats biomoléculaires sans membrane. Nous soutenons qu'il ne s'agit pas de descriptions concurrentes, mais de positions le long d'un seul continuum, et proposons "compartiment transcriptionnel" comme terme générique. Nous nous penchons ensuite sur la littérature fonctionnelle et nous demandons ce que ces compartiments ont montré qu'ils pouvaient faire, et ce qu'ils n'ont pas fait. La preuve la plus claire d'un rôle fonctionnel de condensation pourrait émerger dans des contextes où la transcription doit générer des réponses de type interrupteur, telles que des décisions de destin cellulaire, des réponses au stress, la détection de l'environnement et la maladie. Toutefois, une grande partie de la biologie restante se situe dans les petits assemblages transitoires entre les deux extrêmes. Ceux-ci sont les plus difficiles à étudier, en partie parce qu'ils se situent en dessous de la limite de diffraction de la microscopie lumineuse et parce que les interactions qui conduisent à leur formation exécutent généralement également leur fonction, de sorte que les deux ne peuvent pas être perturbés indépendamment. Nous examinons l'outil expérimental et computationnel disponible pour ce problème et décrivons les défis méthodologiques ouverts qui demeurent.
Quail et al. (Thu,) ont étudié cette question.