Expression des gènes liés à l'auto-immunité dans le mélanome

(1) Contexte. La dysrégulation de la réponse immunitaire joue un rôle clé dans le mélanome, comme le suggère l'amélioration substantielle du pronostic observée sous thérapie de modulation immunitaire. De même, le rôle de l'auto-immunité fait l'objet de nombreuses investigations dans le mélanome et d'autres cancers. (2) Méthodes. L'expression de 98 gènes liés à l'auto-immunité a été étudiée chez 1948 individus (1024 mélanomes et 924 contrôles sains). Les données ont été dérivées de quatre bases de données indépendantes, à savoir, GEO à la phase de sélection, et Ist Online, GEPIA2 et GENT2, lors de trois étapes de validation successives. Des analyses ROC ont été réalisées pour mesurer la capacité à discriminer le mélanome des contrôles. L'analyse en composantes principales (ACP) a été utilisée pour combiner les données d'expression ; une analyse de survie a été effectuée sur la plateforme GEPIA2. (3) Résultats. Les niveaux d'expression de NOD2, BAX, IL-18 et ADRB2 se sont révélés significativement différents dans le mélanome par rapport aux contrôles et discriminent le mélanome des contrôles de manière extrêmement efficace, que ce soit en tant que molécules uniques (AUC > 0,93 dans tous les cas) ou en tant que profil, selon l'analyse ACP. Les patients montrant une forte expression de NOD2 et d'IL-18 présentent également une amélioration significative de la survie par rapport aux patients à faible expression. (4) Conclusions. Quatre gènes fortement liés à l'auto-immunité montrent une expression altérée significative dans les échantillons de mélanome, mettant en évidence le rôle qu'ils peuvent jouer dans le mélanome.