वादे से अभ्यास तक: संरक्षण में गैर-आक्रामक नमूनाकरण के साथ जीनोमिक्स का संयोजन

संरक्षण जीनोमिक्स एक बढ़ती हुई लोकप्रिय शब्द बन गया है, फिर भी यह स्पष्ट नहीं है कि क्या कई संरक्षण-संबंधित अध्ययन के लिए आवश्यक गैर-आक्रामक नमूनाकरण अगली पीढ़ी के अनुक्रमण प्रौद्योगिकियों का लाभ उठाने के लिए न्यूनतम आवश्यकताओं के साथ संगत है। यहाँ, हमने जलवायु-संवेदनशील स्तनधी, अमेरिकी पिका (Ochotona princeps) में एक साथ एकल न्यूक्लियोटाइड पोलिमॉर्फिज़्म (SNPs) की पहचान करने और जीनोटाइप करने के लिए गैर-आक्रमक तरीके से एकत्र किए गए बाल के नमूनों के जीनोटाइपिंग-बाय-सीक्वेंसिंग का उपयोग करने की व्यवहार्यता का मूल्यांकन किया। हमने दो ऊंचाई के ट्रांसेक्ट्स के साथ वितरित आठ स्थलों में 3,803 उच्च-विश्वास SNPs की पहचान की और जीनोटाइप किया, प्रारंभिक DNA मात्रा 1 ng जितनी कम थी। पचपन आउटलेयर लोकेस को विभाजन चयन के तहत उम्मीदवार जीन क्षेत्रों के रूप में पहचाना गया, जो भविष्य की मान्यता के लिए संभावित लक्ष्य बनाते हैं। जीन विविधता के जीनोम-व्यापी अनुमान दोनों ट्रांसेक्ट्स में ऊंचाई के साथ महत्वपूर्ण और सकारात्मक रूप से सह관련ित थे, जिसमें सभी कम ऊंचाई के स्थलों में संभवतः अंतर्विवाह के कारण महत्वपूर्ण हेटेरोज़ायगोट घाटा प्रदर्शित किया गया। अधिक व्यापक रूप से, हमारे परिणाम उन विभिन्न मुद्दों को उजागर करते हैं जिन्हें गैर-आक्रामक नमूनाकरण के साथ जीनोमिक डेटा संग्रह के संयोजन के समय विचार किया जाना चाहिए, विशेष रूप से एक्सोजेनस DNA को कम करने के लिए फील्ड सैंपलिंग प्रोटोकॉल, लक्षित जीव की उपज को बढ़ाने के लिए डेटा संग्रह रणनीतियों और गुणवत्ता नियंत्रण कदमों, और पुनर्प्राप्त जीनोमिक डेटा की लागत-प्रभावशीलता और सूचना सामग्री को अधिकतम करने के लिए विश्लेषणात्मक दृष्टिकोणों से संबंधित।