ミトコンドリア脂質代謝関連遺伝子シグネチャーが大腸癌における予後と免疫環境を予測する

背景：大腸癌（CRC）は、グローバルな健康に重大な影響を与える非常に侵襲的な消化管悪性腫瘍です。ミトコンドリア脂質代謝遺伝子はCRCの進行に影響を与えることが知られていますが、その予後的関連性は十分に探求されていません。方法：本研究は、CRC患者におけるミトコンドリア脂質代謝関連遺伝子の発現プロファイルと予後的意義を系統的に評価しました。TCGAおよびGEOデータベースからのデータを使用してリスクモデルを構築しました。さらに、腫瘍微小環境（TME）、免疫細胞浸潤、腫瘍変異負荷、ミクロサテライト不安定性（MSI）および薬剤感受性を調査しました。コアミトコンドリア脂質代謝に関連する重要な遺伝子が同定され、in vitroの細胞実験を通じて機能的検証が行われました。結果：ABHD4、ABHD8、HDHD5、PNPLA4、GK5、CPT2、YJEFN3、CRYAB、HSPA1A、MAPK1、ATG7、HDAC3、およびACAT2を含むミトコンドリア脂質代謝関連遺伝子が同定されました。リスクスコアと主要な臨床変数（pTNMステージおよび年齢）を統合したノモグラムが開発され、患者の結果を予測しました。リスク群間で免疫細胞浸潤に有意差が観察されました。免疫微小環境の分析により、リスク群間の免疫細胞浸潤に有意な差があり、リスクスコアがTME関連遺伝子および免疫チェックポイント分子の発現と有意に相関していることが示され、ハイリスク群において顕著な免疫抑制微小環境が存在することが示唆されました。さらに、TIDE分析では、リスクスコアと免疫、間質スコアおよびMSIを組み合わせることで、免疫療法の利益をより効果的に予測できる可能性が示されました。さらに、in vitro実験により、2つの重要な遺伝子、ABHD4およびYJEFN3のノックダウンがCRC細胞の増殖、移動および浸潤を有意に抑制することが示され、これらの腫瘍促進的役割を支持しました。結論：このミトコンドリア脂質代謝に基づくリスクモデルは、有望な予後バイオマーカーを代表し、CRC管理における個別化治療戦略の指針を提供する可能性があります。